Peter Rabbit 2: The Runaway akan melanjutkan kisah kelinci nakal bersama Peter. Kali ini Bea (Rose Byrne) dan Thomas (Domhnall Gleeson) memutuskan untuk menikah. Namun Peter tetap tidak menyukai Thomas, ia merasa Thomas masih benci kepadanya. Saat Bea dan Thomas akan memiliki seorang anak, Peter memutuskan pergi dan berpetualang bersama teman-temannya. Namun kelinci nakal ini menemui masalah saat beberapa temannya tertangkap di pusat kota. Mampukah Peter membebaskan kawan-kawannya itu?